要关闭MongoDB数据库的运行，你可以按照以下步骤进行操作：
1. 打开终端或命令提示符窗口。
2. 输入以下命令，以默认配置关闭MongoDB数据库：
mongod --shutdown
3. 如果你使用的是非默认配置的MongoDB实例，请在命令中指定配置文件的路径：
mongod --dbpath /path/to/db --shutdown
4. 提交命令后，MongoDB将停止运行并关闭数据库。你可以检查终端或命令提示符窗口的输出，确认数据库已成功关闭。
请注意，关闭MongoDB数据库时确保没有正在进行的重要操作，以免数据丢失或损坏。